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　　曲池与郑和义子有一段雾水之缘，诞下的是王爷的骨肉，郑和对王九甚是感激，更赐下十二金针给王九，从此王九不需注册，代郑和行医！ 王九医馆因郑和赏赐金针而声名大躁，不少达官贵人前来求医。 一姑乍然发觉草堂竟是自己之子，惊喜交杂，但怕影响草堂的前程，却不敢相认。 原来当年农金匮帮一姑顺利产子，后金匮被惠帝追杀，一姑有感对自己儿子有救命之恩，便与金匮儿子掉换，那即是说，平常是医神农金匮之子！ 素问与灵枢的性格经常对掉，使平常与草堂互起纷争，亦感到困扰。

　　王九虽被禁行医，但街坊却继续前来医馆医病、玩乐。天命也奈他莫何！ 草堂对素问坦白已有心上人，素问找到钓鱼的平常哭诉，二人独处一宿，互生情愫。 素问与平常、灵枢与草堂彼此柔情蜜意，三人沉浸在恋爱的幸福之中。 京城第一名妓曲池，晕到街中指定找天命诊治。而天命诊脉知此女有孕后则推给了王九，此女顺利诞下婴儿。王九却因此被抓入衙门。 王九在众人的依依不舍下将被衙役押出京城，郑和的一张令牌将他释放。

　　天命想出一计，要把王九推下深渊，永不超生，就是举办【天下医馆大赛】…… 平常、幸福得知有天下医馆比赛，都希望王九参加，但王九却不感兴趣。 王九被逼无奈派平常去参加，平常为习医大吃苦头。 天命也决定派草堂出战，草堂亦希望为天命医馆得到殊荣，更加倍努力研习。谁知灵枢却不时前来捉弄草堂，令草堂无法专心，但草堂感到灵枢的出现，令自己生活添上不少生趣。 大赛之期终至，经过三局比赛，平常与草堂平局，但郑和以王九医馆没有执照，取消平常比赛资格，王九医馆被封。天命医馆取胜。